[ilidan]

Ne možeš da ukloniš audio bez rekompresije videa a to oduzima vreme i kvari kvalitet slike koji je i tako loš na YT.
Samo video, bez rekompresije možeš da sačuvaš sa programom Avidemux (učitaš fajl, Video podesiš na Copy a u Audio - Select tracks dečekiraš sve što je čekirano).

Alternativno, možeš da koristiš FLVExtract za FLV fajove, MP4Box za MP4 fajlove i MKVToolnix (mmg.exe) za MP4 i WEBM. Ipak, mislim da ti je Avidemux najbolje rešenje.